本报讯(通讯员 姚梦婷)近日,玉米团队研究成果以“GEFormer: a Genomic Pre-diction Method of Genotype-Environment In-teraction in Maize by Integrating GatingMechanism MLP and Linear Attention Mech-anism”为题在 Molecular Plant 发表。研究从基因型与环境互作的角度,提出了一种融合门控机制 MLP 与线性注意力机制的基因组预测方法 GEFormer。
与现有的基因组预测方法相比 ,GEFormer 在不同表型的预测中具有更高的准确性,且在不同环境和材料的预测中具有较好的泛化能力。同时,该研究开展了GEFormer 预测未知环境表型的准确率、基于自交系预测杂交种的表型、跨群体表型预测三个场景中的应用,并对预测模型捕获的生物学特征进行了分析。未来可以集成更多群体的数据集,有望突破不同遗传背景群体间的瓶颈。