德州学院 - 《德州学院报》
学校在国际期刊《核酸研究》上发布EVLncRNAs数据库最新研究成果
作者：生物物理研究院 周百灵
2023-11-20
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本报讯 近日，我校“山东省生物物理重点实验室”和“深圳湾实验室”的王吉华教授、周耀旗教授和周百灵副教授带领团队在《核酸研究》（NucleicAcidsResearch，影响因子14.9）上发表了题为“EVLncRNAs3.0:anupdatedcomprehensivedatabaseformanuallycuratedfunctionallongnon-codingRNAsvalidatedbylow-throughputexperi鄄ments”的文章，构建了国际上实验证实功能性长非编码RNA（lncRNA）的最全面数据资源库，为lncRNA的研究奠定了基础，对于深入认识lncRNA在多种疾病中的作用及其作为潜在治疗靶标的发现具有重要意义。
lncRNA数据资源库从日益增长的每年近万篇出版物中挖掘散落在文献海洋中的数据信息，建设一个国际上权威可靠、实时更新的功能性lncRNA综合数据库既迫切需要又十分重要，工作量艰巨，需要持续不断地更新优化，更需要不断地创新发展。该团队成员多年如一日，攻坚克难，在国际上率先建立了最全的功能性lncRNA综合数据库EVLncRNAs，首个版本于2018年发表在《核酸研究》(NucleicAcidsResearch)上，又经过3年多持续努力，2021年在 《核酸研究》(NucleicAcidsResearch)上发布了升级版2.0版本。数据库已被60多个国家的研究人员访问两万三千余次，论文被国内外科研人员引用100多次，已成为全球研究者广泛访问和引用的实验证实的lncRNA数据资源。本次新版本EVLncRNAs3.0是在2.0版本的基础上进行了全面更新，综合运用多种手段持续不断挖掘功能性lncRNA，用人工的方式从25000多篇文献中提取功能数据信息、并整合近10个数据库相关数据信息建立起来的，是目前国际上功能性lncRNA最全的数据资源库，该版本为lncRNA研究者和应用开发者提供了一个更加全面、更强大的功能性lncRNA数据信息集合，可从全局角度窥视已发现功能性lncRNA的全貌，这对于新的lncRNA的发现、新功能探索以及深入认识这些分子的生物学功能和潜在的临床应用均具有不可估量的重要价值。
基于EVLncRNAs3.0数据库第一手数据，本团队对lncRNA进行了初步挖掘分析，全面分析了lncRNA与不同物种、疾病以及其相互作用因子之间的关联，为理解lncRNA的功能提供了宏观全局视角。该项研究得到了国家自然科学基金、山东省高校青创人才引育计划和山东省自然科学基金等项目的资助。