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西南林业大学 - 《西南林业大学报》

兰科叶绿体基因组演化研究取得新进展

作者:李璐    
2023-09-30     浏览(18)     (0)

生物多样性保护学院兰科多样性研究小组在《BMC基因组学》杂志上发表了一篇文章,介绍了他们对华西蝴蝶兰和滇西蝴蝶兰的叶绿体全基因组序列研究,分析了它们的基因组特征并构建了系统发育树。共同作者包括陶磊、段涵宁和陶凯锋等研究生。

生物多样性保护学院兰科多样性研究小组在《BMC基因组学》(BMC Genomics, IF=4.4,中科院2区TOP)上发表题为《Complete chloroplast genome structural characterization of two Phalaenopsis ( Orchidaceae ) species and comparative analysis with their alliance》的文章。

该研究选择了中国特有的华西蝴蝶兰(Phalaenopsis wilsonii)和仅分布于中缅边界的滇西蝴蝶兰(Phalaenopsis stobartiana)为研究对象,利用高通量测序技术(Illumina Novaseq)获得了两种兰花的叶绿体全基因组序列,利用相关软件完成了叶绿体基因组结构组装和基因注释,分析了它们的基因组序列特征,并构建了系统发育树。

第一作者为2021级硕士研究生陶磊,系李青青教授和李璐副研究员联合培养;共同作者2021级研究生段涵宁和2020级研究生陶凯锋参与了数据分析,中国科学院西双版纳热带植物园罗艳研究员参与了论文设计,李璐副研究员为通讯作者。(生物多样性保护学院)