哈尔滨工程大学的校徽由三种不同色阶的蓝色构成圆形,象征着学校为船舶工业、海军装备、海洋开发和核能应用等领域服务,校名采用毛体字和英文名称,标志性建筑及建校时间形成光环效果,寓意学校继承军工传统。校徽象征着师生凝聚、团结和对美好未来的追求及向高水平研究型大学迈进的信心和勇气。