屠鹏飞教授致力于中药药效物质与新药创制、中药质量分析、中药资源发展与利用。他承担了国家和省部级项目70余项,成功研制二类新药2项,获得新药证书4个;在研一类、五类新药10多项,获得临床批件6个。他长期致力于沙漠植物肉苁蓉的研究,攻克了寄生植物人工种植的多项关键技术,建立了荒漠肉苁蓉、管花肉苁蓉及其寄主植物的高产稳产种植技术,并在内蒙古西部和新疆南疆地区大规模推广。屠鹏飞教授被授予内蒙古阿拉善盟荣誉公民和新疆和田地区科学技术特等奖。